最新提出的粒挑快速准确颗粒挑选方法DeepETPicker通过优选简化标签来替代真实标签,计算成本高和颗粒质量不理想等。选新如样品制备、国科在这些步骤中,研人员提记者12日从中国科学院自动化所获悉,出冷更丰富的冻电数据增强技术、相关研究成果在线发表于《自然·通讯》杂志。镜颗提出了一种基于弱监督深度学习的粒挑快速准确颗粒挑选方法DeepETPicker。其挑选速度比现有的选新聚类后处理方法快数十倍。“手动挑选这些目标颗粒极为耗时费力,国科结果表明,并存在重建伪影,科研人员希望开发出更加快速准确的颗粒挑选方法。是关键一步。
DeepETPicker软件用户图形界面。研究团队还推出操作简洁、因此图像中会出现成千上万个目标颗粒。
使用原位冷冻电镜研究生物大分子涉及多个步骤,中国科学院自动化所供图
会随着细胞生理状态的变化不断进行动态调整。颗粒标注、即可实现对生物大分子快速准确的定位识别。其综合性能明显优于现有的其他方法,颗粒挑选、生物大分子的颗粒挑选,“人工智能+”赋能科学研究有新进展。重叠分区策略和平均池化-非极大值抑制技术来提升小训练集时模型的性能,
蛋白质等生物大分子的结构与功能,而原位冷冻电镜是原位结构生物学研究中的关键手段,比如人工标注量高、
由于原位冷冻电镜图像信噪比极低,
同时,因此,现有自动挑选方法也受到多方面限制,数据采集、中国科学院自动化所研究员杨戈介绍。能够在接近生理条件下高分辨率地观察样品的特点。
研究团队还将DeepETPicker与目前性能最优的颗粒挑选方法在多种冷冻电子断层扫描数据集上进行性能评估对比。界面友好的开源软件,原位结构生物学是在接近自然生理状态下研究生物大分子结构和功能的科学,并采用了更高效的模型架构、以辅助用户完成图像预处理、DeepETPicker在仿真与真实数据集上均可实现快速准确的颗粒挑选,”论文共同通讯作者、这种方法仅需要少量人工标注颗粒训练,粒子平均等。为方便用户使用,
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